2003

Президентом Харківського територіального відділення МАН України обрано ректора університету, професора В. С. Бакірова.

Університет отримав статус самоврядованого (автономного) державного вищого навчального закладу України, який має право самостійно визначати пріоритетні напрями і форми науково-педагогічної діяльності, створювати факультети, навчально-наукові, науково-дослідні інститути.

Затверджено склад Наглядової ради Харківського університету, головою якої став завідувач відділу регіональних проблем історії України Інституту історії України НАН України, академік П. Т. Тронько.

Університет було внесено до Світового довідника вищих медичних навчальних закладів Всесвітньої організації охорони здоров’я (ВООЗ) та Міжнародного довідника Фундації охорони здоров’я медичної освіти (США).